Synopsis Complet
Après le meurtre de son père, Ryuuko Matoi parcourt le pays à la recherche de son assassin. Suivant sa seule piste – la moitié manquante de son invention, la lame de ciseaux – elle arrive à la prestigieuse Académie Honnouji, un lycée pas comme les autres. L'académie est dirigée par l'imposante et impitoyable présidente du conseil étudiant, Satsuki Kiryuuin, aux côtés de ses puissants subordonnés, les Elite Four. Dans la hiérarchie brutalement compétitive de l'école, Satsuki confère aux plus hauts gradés des vêtements spéciaux appelés « Uniformes Goku », qui confèrent à celui qui les porte des capacités surhumaines uniques.
Complètement battue lors d'un combat contre l'un des étudiants en uniforme, Ryuuko se retire dans sa maison rasée où elle tombe sur Senketsu, un « Kamui » rare et sensible, ou vêtements de Dieu. Après être entré en contact avec le sang de Ryuuko, Senketsu se réveille, s'accrochant à elle et lui fournissant un immense pouvoir. Maintenant, armée de Senketsu et de la lame de ciseaux, Ryuuko prend position contre les Elite Four, dans l'espoir d'atteindre Satsuki et de découvrir une fois pour toutes le coupable du meurtre de son père.