Synopsis Complet
Pour contrer la menace que représentent les Gastrea, les « enfants maudits » – des filles dont le corps contient des traces du virus qui leur confèrent des capacités surhumaines – officiellement appelés Initiateurs par la sécurité civile de Tendo, se voient attribuer des partenaires appelés Promoteurs, des personnes qui travaillent pour guider et protéger les jeunes Initiateurs. Ces équipes de deux personnes sont envoyées en mission pour combattre les monstres créés par le virus Gastrea et les tenir à distance.
Black Bullet tourne autour de l'équipe d'Enju Aihara, un initiateur, et de Satomi Rentaro, un promoteur, alors qu'ils partent en mission pour lutter contre la menace croissante de Gastrea dans leur ville natale de Tokyo.