Synopsis Complet
La vie ordinaire du lycéen Ayato Kamina est bouleversée lorsque Tokyo est soudainement envahie par des avions de combat futuristes. Au milieu du chaos, il rencontre une femme appelée Haruka Shitow qui prétend appartenir à une organisation gouvernementale appelée TERRA. Elle révèle qu'il vit dans une bulle temporelle nommée « Tokyo Jupiter » qui a été mise en place par les Muliens – des humanoïdes d'une autre dimension – dans le but d'isoler et de prendre le contrôle de Tokyo. Depuis, TERRA tente de briser la barrière qui entoure la ville.
Incapable de traiter la révélation, Ayato panique et s'enfuit. Il rencontre sa camarade de classe Reika Mishima qui le conduit à un endroit appelé "Le Sanctuaire de Xephon" où sommeille un gros œuf. Elle commence à chanter et un pouvoir inconnu s'éveille en Ayato, le reliant à un être appelé RahXephon qui sort de l'œuf. Peu de temps après, Haruka le retrouve et tente de le faire rejoindre sa cause de lutte contre les Muliens.
Pris entre la ligne de mire des Muliens et de TERRA, Ayato commence à remettre en question son objectif, naviguant dans des souvenirs altérés et finalement dans son identité même dans ce nouveau monde chaotique.
Incapable de traiter la révélation, Ayato panique et s'enfuit. Il rencontre sa camarade de classe Reika Mishima qui le conduit à un endroit appelé "Le Sanctuaire de Xephon" où sommeille un gros œuf. Elle commence à chanter et un pouvoir inconnu s'éveille en Ayato, le reliant à un être appelé RahXephon qui sort de l'œuf. Peu de temps après, Haruka le retrouve et tente de le faire rejoindre sa cause de lutte contre les Muliens.
Pris entre la ligne de mire des Muliens et de TERRA, Ayato commence à remettre en question son objectif, naviguant dans des souvenirs altérés et finalement dans son identité même dans ce nouveau monde chaotique.
