Synopsis Complet
Par une journée ensoleillée de juillet de la 41e année de l'ère Shinka, Jirou Hitoyoshi est chargé d'écouter secrètement une réunion secrète entre un scientifique de haut niveau du gouvernement et un espion industriel. Cependant, sa couverture est dévoilée et l'espion se révèle être un extraterrestre déguisé. Au milieu du chaos qui s'ensuit, Jirou fait appel à la serveuse de café et fille magique Kikko Hoshino, l'un des nombreux « surhumains » qui se fondent dans la société et protègent secrètement l'humanité des menaces extraterrestres. En tant que membre de l'agence gouvernementale connue sous le nom de Super Population Research Laboratory, Jirou a la double tâche de protéger les surhumains qui défendent l'humanité et d'éliminer ceux jugés trop dangereux pour vivre. Ayant prouvé qu'elle était une alliée digne de ce nom, Kikko est invitée à rejoindre l'agence en tant que nouvelle recrue.
Cinq ans plus tard, la désapprobation et le dégoût pour les surhumains sont désormais monnaie courante à Tokyo. De la corruption gouvernementale et des idées contradictoires sur la justice à la moralité des droits surhumains, la relation entre les humains et la minorité surnaturelle s'équilibre de manière précaire dans un monde imprégné de murmures d'agitation et de malaise. Dans des circonstances mystérieuses, Jirou a trahi l'agence et est désormais un fugitif en fuite. Alors qu'il se promène dans les ruelles pluvieuses de Shinjuku, il est poursuivi par les mêmes surhumains qu'il a lui-même recrutés autrefois.