Synopsis Complet
Silencieux, apathique mais espiègle, Rokujou Miharu, 14 ans, est le porteur du hijutsu « Shinrabanshou », une technique puissante que de nombreux clans ninja désirent pour devenir le dirigeant de Nabari. Son camarade de classe Kouichi Aizawa et son professeur d'anglais Thobari Durandal Kumohira sont tous deux secrètement des ninjas du clan Banten qui se sont engagés à protéger Miharu de ses nombreux attaquants. Restant apathique, Miharu tente de rejeter leur invitation à rejoindre leur « club » ninja. Cependant, après de nombreuses attaques, il ne trouve d'autre choix que de rejoindre leur groupe pour survivre. Lentement, Miharu se rapproche de plus en plus de devenir le dirigeant de Nabari.