Synopsis Complet
Nous sommes en 2004 après J.-C., et le chaos éclate alors qu'une mystérieuse race extraterrestre ressemblant à des grenouilles remplit le ciel d'ovnis – c'est du moins ce que rêve Fuyuki Hinata, 12 ans. Par coïncidence, le sergent Keroro, chef d'une équipe préliminaire pour l'invasion kéronienne de Pekopon – le nom extraterrestre de la Terre – commence sa mission en envahissant la maison de Fuyuki. Après avoir maîtrisé le garçon et sa sœur, Keroro envisage de retrouver ses camarades et de retourner au vaisseau-mère pour réparer son précieux dispositif d'invasion, le Kero Ball. Malheureusement, il apprend que le quartier général a abandonné la récupération de son unité en raison d'un problème sans précédent qui a forcé le reste des Kéroniens à fuir.
Par conséquent, Keroro est obligé de rester à la résidence Hinata avec le sympathique Fuyuki aux yeux étoilés ; sa sœur athlétique et colérique Natsumi ; et leur mère travailleuse et attrayante, Aki. Désormais bloqués jusqu'à nouvel ordre, Keroro et son peloton passent chaque jour à comploter pour dominer le monde, mais sont à chaque fois contrecarrés par divers facteurs inattendus. Néanmoins, en vivant aux côtés des humains, ils apprennent à les traiter comme des amis et des alliés, nouant ainsi des liens à la fois comiques et significatifs qui valent la peine de leur vie sur Terre.