Synopsis Complet
Sherlock Shellingford, Nero Yuzurizaki, Hercule Burton et Cordelia Glauca forment "Milky Holmes", un groupe reconnu comme la crème de la crème de la Holmes Detective Academy, basée à Yokohama. Cependant, lors d'une escarmouche contre le voleur fantôme Arsène, leurs jouets disparaissent soudainement, les jugeant inaptes à continuer leur rôle de détectives. Dépouillés de leur vie prestigieuse et jetés dans un grenier délabré, ils risquent l'expulsion s'ils ne parviennent pas à retrouver leurs pouvoirs dans les trois mois.
Tantei Opera Milky Holmes raconte l'histoire d'un groupe autrefois légendaire dans son voyage pour récupérer ses jouets, ainsi que sa tentative de poursuivre son travail sans les pouvoirs qui définissaient autrefois sa carrière.